李奇渊

李奇渊  “青年千人”计划


职称副教授/博导

学科(专业):转化医学

研究方向:计算生物学,基因组学

邮箱qiyuan.li@xmu.edu.cn

电话:0592-2185175


教育背景:

1996-2000华东理工大学 本科

2000-2003厦门大学 细胞生物学 硕士

2004-2006丹麦科技大学生物信息学 硕士

2006-2010丹麦科技大学系统生物学博


工作经历:

2010.03-1012.03哈佛癌症中心 博士后

2012.05-2017.07厦门大学副教授


主要研究领域:

李奇渊主要从事针与肿瘤基因组相关的转化医学研究:运用统计学模型从基因组大数据中寻找与肿瘤分型,预后,化疗敏感性等临床特征有关的遗传标记;通过多元模型对肿瘤遗传多态性,体细胞变异,综合表观遗传学特征和基因表达进行分析建模,认识和理解肿瘤风险因子的生物学功能;分析肿瘤基因组体细胞水平上的各种变异类型及其调控机制



主要学术成果:

论文:

1

Li Q, Seo J H, Stranger B, et al. Integrative eQTL-Based Analyses Reveal the Biology of Breast Cancer Risk Loci[J]. Cell, 2013, 152(3):633-41.

2

Li Q, Eklund A C, Birkbak N J, et al. Consistent metagenes from cancer expression profiles yield agent specific predictors of chemotherapy response[J]. Bmc Bioinformatics, 2011, 12(2):: 310.

3

Li Q, Birkbak N J, Gyorffy B, et al. Jetset: selecting the optimal microarray probe set to represent a gene[J]. Bmc Bioinformatics, 2011, 12(1):1-7.

4

Seo J H, Li Q, Fatima A, et al. Deconvoluting complex tissues for expression quantitative trait locus-based analyses.[J]. Philosophical Transactions of the Royal Society B Biological Sciences, 2013, 368(1620):20120363-20120363.

5

Li Q, Stram A, Chen C, et al. Expression QTL-based analyses reveal candidate causal genes and loci across five tumor types[J]. Human Molecular Genetics, 2014, 23(19):5294-302.

6

Lawrenson K, Li Q, Kar S, et al. Cis-eQTL analysis and functional validation of candidate susceptibility genes for high-grade serous ovarian cancer.[J]. Nature Communications, 2015, 6:45-53.

7

Li Y, Zou L, Li Q

主持课题:

Chen W, Li Z, Hu J, Zhang Z, Chen L, Chen Y, Liu Z (corresponding) . Corneal alternations induced by topical application of benzalkonium chloride in rabbit. PLoS One. 2011;6(10):e26103

获奖:

国家千人计划第十批人才引进人才